بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره ۶ گاو های نژاد هلشتاین

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

 بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره ۶ گاو های نژاد هلشتاین دارای ۲۱ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره ۶ گاو های نژاد هلشتاین  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره ۶ گاو های نژاد هلشتاین،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره ۶ گاو های نژاد هلشتاین :

نام کنفرانس، همایش یا نشریه : مجله بیوتکنولوژی کشاورزی

تعداد صفحات :۲۱

در مطالعات ارتباطی و انتخاب ژنومی تعیین وسعت عدم تعادل لینکاژی، در تشخیص میزان نشانگر مورد نیاز و اندازه نمونه، اهمیت دارد. دراین پژوهش از ۱۰۸۹ گاو نر هلشتاین نمونه خون و اسپرم تهیه شد و با استفاده از بسته نشانگری K50 شرکت ایلومینا ژنوتیپ ۲۰۳۰ نشانگر بر روی کروموزوم شماره ۶ بر مبنای اسمبلی UMD3.1 ژنوم گاو تعیین شد. داده ها برای جهش تک نوکلئوتیدی نادرست و افراد با ژنوتیپ های نامشخص با استفاده از نرم افزار Plink تصحیح شد. پس از تصحیح ۱۶۰۶ نشانگر (%۷۹) باقی ماند. متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده شده ۰.۳۷ بود و %۸۰ نشانگر ها حداقل فراوانی آللی بالاتر از ۰.۲ داشتند. عدم تعادل لینکاژی با محاسبه دو پارامتر D’ و r2 از طریق نرم افزار Haploview محاسبه شد. در این مطالعه وسعت عدم تعادل لینکاژی ۴۰kb (r2=0.3) برآورد شد و مقدار r2 در ۸۰kb به ۰.۲ (سطح متوسط) و در ۳۰۰kb به ۰.۱ (سطح پایه) کاهش یافت.اندازه موثر جمعیت در ۱۰ نسل قبل حدود ۱۰۰ راس بود. علاوه بر این، ۴۹ بلوک هاپلوتیپی با دامنه kb472-18 و پوشش ۱۰.۶Mb از کل کروموزم شناسایی شد. نتایج این پژوهش نشان داد که بطور تقریبی بین ۷۰۰۰۰- ۴۰۰۰۰ نشانگر یا یک نشانگر به ازاء هر ۴۰-۷۵ kb برای مطالعات ارتباطی کل ژنوم در این جمعیت مورد نیاز است.

کلید واژه: عدم تعادل لینکاژی، گاو هلشتاین، کروموزوم ۶، اندازه موثر جمعیت