بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

 بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا دارای ۱۰ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا :

نام کنفرانس، همایش یا نشریه : علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)

تعداد صفحات :۱۰

به منظور بررسی تمایل اسیدهای آمینه مجاور (دوتایی) در ساختمانهای دوم از نوع مارپیچ آلفا، مکانهای مورد مطالعه در مارپیچ آلفا بدین شکل انتخاب شدند: N,Ncap,NI,N2,N3,N4,C3,C2,C1,Ccap,C, در این مکانها توالیهای دوتایی مورد بررسی عبارت بودند از N1N2, N2N3, N3N3, N3N4, M1M2, M2M3, C4C3, C3C2, C2C1, C1Ccap, CcapCترجیح قرار گرفتن هر اسید آمینه در هر جایگاه مارپیچ آلفا و ترجیح قرار گرفتن ۴۰۰ توالی دوتایی درجایگاههای دوتایی مختلف مارپیچ آلفا محاسبه ومقایسه شد، بدین منظور یک بانک اطلاعاتی از مارپیچ آلفا با ۳۷۰۵ مارپیچ طراحی شد و مورد استفاده قرار گرفت. در این بانک مارپیچ‌ها حداقل دارای ۷ اسید آمینه بوده واز مجموعه ۶۹۶ پروتئین با تشابه کمتر از ۲۵% تشکیل شده بودند. Single local propensity SLP برای همه ۲۰ اسید آمینه در جایگاه های مختلف مارپیچ آلفا محاسبه گردید. علاوه بر این observed Doublet Local propensity DLPO که براساس تکرار اسیدهای آمینه دوتایی استوار است و Expected Doublet local propensity DIPe که به طور مستقیم از روی SLP اندازه گیری میشود نیز محاسبه شد. هرگاه ترجیح قرار گرتفن یک جفت اسید آمینه معین در جایگاه دوتایی خاص از مارپیچ آلفا DLPO بیش از ترجیح محاسبه شده توسط حاصل ضرب جایگاه های تکی در مارپیچ آلفا DLPe باشد یا به عبارت دیگردر صورتی که dlpo>>dlpe باشد. این مسئله تمایل ۲ اسید امینه خاص را در مجاورت با یکدیگر در آن جایگاه از مارپیچ آلفا نشان می دهد. نتایج حاصل نشان داد که توالیها یا دوتایی که در آنها DLPE>>DLPE می باشد عبارتند از: Met-Thr در مکان Glu-pro, N Ncap در مکان Pro-Arg, NcapN1 درمکان N1N2 و Lys-His درمکان Thr-Gly, C2C1 در مکان C1Ccap و در نهایت Gin- pro در مکان Ccap علاوه بر این اسید آمینه Gly درمکان Ccap با تمایل زیادی همراه اسید آمینه های یدروفوب در مکان C مشاهده میشود. بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه در مارپیچهای آلفا، می‌تواند در طراحی مارپیچهای آلفای جدید موجود در پروتئینها و ایجاد تغییرات مورد نظر رد مارپیچهای مورد استفاده قرار گیرد.

کلید واژه: ساختمان دوم، انتهای آمینی، انتهای کربوکسیلیک، آنالیز توالیها، بیوانفورماتیک