مقاله بررسی فیلوژنیک گونههای خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آبهای شمالی خلیج فارس

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

  مقاله بررسی فیلوژنیک گونههای خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آبهای شمالی خلیج فارس دارای ۶ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد مقاله بررسی فیلوژنیک گونههای خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آبهای شمالی خلیج فارس  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی مقاله بررسی فیلوژنیک گونههای خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آبهای شمالی خلیج فارس،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن مقاله بررسی فیلوژنیک گونههای خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آبهای شمالی خلیج فارس :

چکیده

به منظور مطالعه فیلوژنتیکی میگوهای خانواده Penaeidae سواحل بحرکان، از روش تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA استفاده شد. استخراج DNA از عضله پای شنا میگوها با روش CTAB انجام شد. قطعه ژنی ۱۶SrRNA با استفاده از آغازگرهای جهانی ۱۶Sar/16Sbr تکثیر گردید. گرچه بعد از نمونه برداری میگوی Metapenaeus sp. به عنوان گونه M. affinis، شناسایی و جداسازی شد ولی Blast نتایج حاصل از تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA نشان داد که توالی مورد نظر به طور کامل با ژن ۱۶S rRNA، گونه M. monoceros منطبق میباشد. همچنین آنالیزهای بیشتر با استفاده از نرمافزار MEGA Ver. 5 نتیجه به دست آمده را تایید کرد. نتایج حاصل از هم ردیفی توالیهای M. monoceros با استفاده از نرمافزار Clustal W نشان دهنده ۱۷مکان پلی مورفیسم بود که از این تعداد ۱۰ مکان پارسیمونی تشخیص داده شدند. نتایج هم ردیفی توالی ۱۶S rRNA گونه P. stylifera، ۱۴ مکان پلی مورف و ۴ مکان پارسیمونی را نشان داد. نتایج حاصل از نرمافزار Arlequin Ver 3 تنوع هاپلوتیپی را برابر ۱ نشان داد. این توالی ها غنی از تیمین و آدنین ۶۴/۲) درصد) بودند. میزان شاخص R، ۱/۴۱۸ و میانگین واگرایی این دو گونه از هم ۱۰/۹ درصد محاسبه شد. بر اساس نرخ موتاسیون دو درصد به ازای هر میلیون سال برای mtDNA، زمان اشتقاق این دو گونه از هم پنج میلیون و چهارصد و پنجاه هزار سال پیش تخمین زده شد.

کلید واژه: خلیج فارس، فیلوژنتیک، پنائیده، تعیین توالی، ۱۶S rRNA

مقدمه

خلیج فارس علاوه بر داشتن اهمیت سیاسی، نفت و حمل و نقل، دارای آبزیان و ذخایر شیلاتی مهمی است. همراه با پیشرفت تکنولوژی و افزایش سطح آگاهی افراد جامعه نسبت به فواید مصرف آبزیان، تقاضای مصرف انواع آبزیان و بهرهبرداری از دریاها افزایش یافته است که باعث افزایش فشار بر ذخایر آبزیان شده است که در بسیاری موارد با صید بی رویهای مواجه شدهاند. تقریبا” اکثر گونههای کفزی یا کلا” بهرهبرداری شدهاند و یا به طور بی رویهای صید شدهاند و سخت پوستانی مانند میگو بیش از حد مورد بهرهبرداری قرار گرفتهاند .(۳)

میگوهای Penaeidae شامل مهمترین بخش صید جهانی و آبزیپروری است ( (۱۲ که به عنوان غذای دریایی در سطح جهان استفاده میشود و اساسی برای صنعت بزرگ آبزیپروری فراهم میکند .(۷) توالی ژنوم میتوکندریایی به شدت برای توضیح ارتباطات فیلوژنتیکی در میان بسیاری گروههای سخت پوستان مفید است .(۵) مخصوصا” ژنهای زیر واحد بزرگ RNA

۸۶۷

اولین همایش ملی توسعه پایدار دریا محور

دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، ۸-۹ بهمن ۱۳۹۳

ریبوزومی میتوکندری (۱۶S rRNA) و زیر واحد سیتوکروم c اکسیداز (COI) در تجزیه و تحلیلهای فیلوژنی سخت پوستان در سطح گونهها کمک میکند ۳)، ۶ و.(۹

mtDNA به دلیل چندین ویژگی انتخاب موفقی به عنوان نشانگر خواهد بود مانند انتقال مادری محض و بالاترین نرخ جهش (در مقایسه با DNA هستهای) و از دیگر مزایای آن، خصوصیت وراثت غیر جنسی و فقدان نوترکیبی هست. برخلاف آن نوترکیبی mtDNA یک قاعده در بیشتر گیاهان، قارچها و گونههای آغازیان است .(۸) مقایسه مولکولی سه گونه از مهم ترین گونههای میگوی خلیج فارس P.indicus, P.merguensis, P.semiculcatus توسط بابایی در سال ۱۳۸۰ با استفاده از روش RFLP، بر روی ژن mtDNA انجام گردید. نتایج حاصل از این بررسی نشان دهنده متفاوت بودن پراکنش هاپلوتیپ ها در دو منطقه و تفاوت ذخایر این جمعیتها میباشد. محمدی در سال ۱۳۸۱ با استفاده از مطالعات ریختی( مورفومتریک و مریستیک) و مولکولی به روش PCR-RFLP ساختار جمعیت شاه میگوی دریای عمان Panilarus homarus در سواحل استان سیستان و بلوچستان را مورد بررسی قرار داد. مطالعات مولکولی ناهمگنی ژنتیکی را بین مناطق مختلف نمونه برداری نشان نداد.

شجاعی در سال ۱۳۸۲ به برسی مولکولی گونه Metapenaeus affinis با استفاده از mtDNA به روش RFLP در سه منطقه هرمزگان – بوشهر- خوزستان پرداخت ولی اختلافات ژنتیکی بین مناطق مشاهده ننمود و پیشنهاد نمود از روشهای مولکولی دیگر مانند Microsatallite یا RAPD در تحقیقات بعدی استفاده گردد.

مواد و روشها

نمونه برداری از سواحل بحرکان انجام شد. سواحل بحرکان در شمال غربی خلیج فارس، با موقعیت جغرافیایی ۲۴ ، ۴۹درجه طول شرقی و ۵ ، ۳۰ درجه عرض شمالی ، در ۴۰ کیلومتری شمال غربی گناوه و در ۲۸ کیلومتری بندر دیلم در مجاورت شهر هندیجان واقع شده است. صید میگو با استفاده از تور ترال کف روب انجام شد. نمونههای میگو بعد از صید سریعا” شناسایی و جداسازی شدند و در اتانول ۹۶ درصد فیکس شدند و به آزمایشگاه بیوتکنولوژی دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر انتقال داده شدند.

تعداد ۵ نمونه از محصولات PCR میگوی Metapenaeus affinis و ۷ نمونه از محصولات PCR میگوی Parapenaeopsis stylifera ،در میکروتیوپ های ۱/۵ ml، که درب آنها به منظور جلوگیری از تبخیر شدن با پارافیلم پوشیده شده بود برای تعیین توالی خودکار به شرکت تکاپو زیست فرستاده شد. محتویات هر میکروتیوپ شامل ۴۰ میکرو لیتر از محصول PCR بود. همچنین آغازگرهای جلودار و برگشتی هم برای این منظور به شرکت نامبرده فرستاده شدند.