مطالعات بیوانفورماتیکی جهت ایجاد مقاومت چندگانه به جدایه های ایرانی پوتی ویروس های مهم کدوییان با استفاده از مکانیسم خاموشی آر ان آ

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

 مطالعات بیوانفورماتیکی جهت ایجاد مقاومت چندگانه به جدایه های ایرانی پوتی ویروس های مهم کدوییان با استفاده از مکانیسم خاموشی آر ان آ دارای ۱۲ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد مطالعات بیوانفورماتیکی جهت ایجاد مقاومت چندگانه به جدایه های ایرانی پوتی ویروس های مهم کدوییان با استفاده از مکانیسم خاموشی آر ان آ  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی مطالعات بیوانفورماتیکی جهت ایجاد مقاومت چندگانه به جدایه های ایرانی پوتی ویروس های مهم کدوییان با استفاده از مکانیسم خاموشی آر ان آ،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن مطالعات بیوانفورماتیکی جهت ایجاد مقاومت چندگانه به جدایه های ایرانی پوتی ویروس های مهم کدوییان با استفاده از مکانیسم خاموشی آر ان آ :

تعداد صفحات :۱۲

چکیده مقاله:

کدوییان گروهی از مهمترین محصولات کشاورزی کشت شده در ایران می باشند. دو گونه ویروس موزاییک هندوانه (Watermelon mosaic virus-2, WMV-2) و ویروس موزاییک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV) متعلق به جنس Potyvirus می باشند که خسارت زیادی را به کدوییان ایجاد می کنند. در این پژوهش امکان طراحی نرم افزاری یک سازه با کارایی مناسب جهت ایجاد مقاومت به این دو ویروس بررسی شد. طراحی ساختار آر ان ای سنجاق سری به منظور ایجاد یک لاین مقاومی از کدوییان که بتواند در برابر هر دو ویروس از مقاومت قابل توجهی در آلودگی های منفرد و یا دوتایی بصورت هم زمان برخوردار باشد انجام گرفت. بدین منظور توالی های نوکلیوتیدی ثبت شده از ژن CP جدایه های ایرانی و همچنین ژن HC-Pro از سایر جدایه های این دو ویروس از بانک ژنی NCBI برای طراحی سازه استفاده شد. بدین منظور توالی های دریافتی با استفاده از برنامه MEGA5 هم ردیف سازی شد و مناطق حفاظت شده شناسایی شدند. ۱۵۰ نوکلیوتید از مناطق حفاظت شده هر یک از ژنهای CP (از نوکلیوتید شماره ۵۶۷ تا ۷۱۷ برای WMV و شماره ۴۶۶ تا ۶۱۶ برای ZYMV) و HC-Pro (از نوکلیوتید شماره ۱۱۱۷ تا ۱۲۶۷ برای WMV و شماره ۱۰۴۶ تا ۱۱۹۶برای ZYMV) از دو ویروس به صورت مستقل انتخاب و پس از قرارگیری در کنار یکدیگر یک توالی ۶۰۰ نوکلیوتیدی به دست آمد. جهت بررسی عدم امکان خاموشی آر ان ای های میزبان، توالی ترکیبی با استفاده از اطلاعات سایت siRNA Scan مورد بررسی قرار گرفت. سپس پیش بینی امکان همسانه سازی آن در یک ناقل دوگانه مناسب با استفاده برنامه Vector NTI version 8.0 انجام شد. درنهایت امکان بیان ساختار آر ان ای سنجاق سری با استفاده از برنامه RNA structure و سایت RNAfold مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج مطالعات بیوانفورماتیکی این پژوهش پیش بینی کرد که قابلیت بیان آر ان ای سنجاق-سری پس از همسانه سازی در حامل مناسب و انتقال به کدوییان در شرایط آزمایشگاهی وجود دارد.