بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های EST

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

 بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های
EST دارای ۲۰ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های
EST  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های
EST،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های
EST :

نام کنفرانس، همایش یا نشریه : زیست فناوری گیاهان زراعی

تعداد صفحات :۲۰

برنج غذای اصلی بیش از نیمی از جمعیت جهان به ویژه کشورهای در حال توسعه است و خشکی مهمترین عامل کاهش عملکرد برنج در آسیا می باشد. این تحقیق به منظور شناسایی ژن های پاسخ دهنده به تنش خشکی با کمک تجزیه و تحلیل اطلاعات EST دو کتابخانه برگ برنج انجام شد. داده های کتابخانه های EST در شرایط شاهد و تنش خشکی، از پایگاه داده NCBI دریافت و با استفاده از نرم افزار EGassembler ویرایش، دسته بندی و هم گذاری شدند. توالی های کانتیگ و سینگلتون به دست آمده به عنوان الگو برای جستجوی بلاست x در بانک توالی پروتیین برنج و انتساب گروه عملکردی با استفاده از نرم افزار CLC Genomic Workbench و AgriGO به کار برده شدند. پروتئین های شناسایی شده در کتابخانه های شاهد و خشکی به ترتیب در۷۰ و ۸۲ گروه کارکردی مختلف قرار گرفتند. برای شناسایی تفاوت های معنی دار بین گروه های کارکردی در کتابخانه های شاهد و تنش خشکی از نرم افزار IDEG6 استفاده شد. بررسی هستی شناسی ژن ها، تفاوت معنی دار در ۲۰ گروه عملکردهای مولکولی، ۳۵ گروه فرایندهای زیستی و ۱۲ گروه اجزای درون سلول را آشکار ساخت. به منظور تعیین بیان افتراقی ژن ها بین دو کتابخانه، ۴۰۱۲ EST دارای کد Unigene با استفاده از الگوریتم پیاده سازی شده در نرم افزار MATLAB انتخاب و با استفاده از نرم افزار IDEG6 تفاوت معنی دار بین ۴۲ ژن تحت تنش خشکی نسبت به شاهد، مشاهده شد (۳۱ ژن افزایش و ۱۱ ژن کاهش بیان). ژن های افزایش بیان یافته، در پاسخ به تنش های محیطی و اکسیداتیو، برقراری هموستازی، پروتئولیز و گلیکولیز نقش داشته و ژن های مربوط به فتوسنتز کاهش بیان نشان دادند.

کلید واژه: برچسب توالی های بیان شده (EST)، برنج، بیان افتراقی ژن ها، خشکی