دانش رسان |
مرکز علم و دانش کشور مقاله بررسی فیلوجغرافیایی موش مقدونیه (Mus macedonicus Petrov & Ruzic 1983) در شمال غرب ایران
در حال بارگذاری
توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد
مقاله بررسی فیلوجغرافیایی موش مقدونیه (Mus macedonicus Petrov & Ruzic 1983) در شمال غرب ایران دارای ۱۲ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است
فایل ورد مقاله بررسی فیلوجغرافیایی موش مقدونیه (Mus macedonicus Petrov & Ruzic 1983) در شمال غرب ایران کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه و مراکز دولتی می باشد.
توجه : در صورت مشاهده بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی مقاله بررسی فیلوجغرافیایی موش مقدونیه (Mus macedonicus Petrov & Ruzic 1983) در شمال غرب ایران،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد
بخشی از متن مقاله بررسی فیلوجغرافیایی موش مقدونیه (Mus macedonicus Petrov & Ruzic 1983) در شمال غرب ایران :
مقدمه
استفاده از داده های مولکولی برای مطالعه نحوه پیدایش، گسترش وفرآیند رشد – کاهش اندازه یا حجم جمعیتها در سالهای اخیر از اهمیت ویژه ای برخوردار شده و به صورت یک روش معتبر و مفید مطرح شده است(۷ و .(۹
در مورد گونه ها یا زیرگونه هایی که میانگین عمر آنها از شروع پیدایش یا زمان حضور آنها در نیمکره شمالی کره زمین بیش از حدود ۲۰۰۰۰ سال تخمین زده می شود، این نوع مطالعات از اهمیت و حساسیت بیشتری برخوردار است، چرا که دوره های مختلف حداکثر یخبندان جهانی و دوره های بین یخبندان بدون شک بر روی سرنوشت موجود مورد مطالعه تأثیر چشمگیر و مؤثری داشته و تخمین زمان پیدایش، یافتن مکان پناهگاههای (Refuges)
موجود ودرک راهها و مسیرهای مهاجرت بدون شک
بایستی با در نظر گرفتن این موضوع اساسی انجام شود ۴)، ۷ و .(۱۲
موش دم کوتاه مقدونیه ( Mus Petrov and Ruzic, 1982 (macedonicus گونه ای از موشهای آزاد زی است که به ندرت به انسان نزدیک شده و اقدام به همزیستی با انسان می کند. این جونده بیشتر در مزارع، باغات و حومه شهرها دیده شده و با آسیب زدن به زمینها و محصولات کشاورزی به عنوان یک آفت مهم به شمار میرود. گسترش جغرافیایی این گونه به صورت پراکنده از اروپای غربی و اطراف کوههای آلپ گزارش شده ولی گسترش اصلی آن مربوط به جنوب شرق اروپا و خاور نزدیک است به طوری که به وسیله کوههای بالکان و دریای مدیترانه از غرب، کوههای قفقاز از شمال وصحراهای عربستان از
۲۸۹
M. macedonicus
M. macedonicus spretoides
مجله پژوهشهای جانوری (مجله زیست شناسی ایران) جلد ۲۶، شماره ۳، ۱۳۹۲
جنوب محدود شده است. گسترش آن به سمت شرق تا زاگرس و حتی در استان قزوین گزارش شده است ۱) و (۶ ولی محدوده شرقی آن بخوبی مشخص نیست ۵)، ۷ و .(۹ اخیراً مطالعات مولکولی اندکی بر روی این گونه انجام شده و نتایج نشان دهنده وجود حداقل دو زیرگونه از این جانور است:
یکی است که به وسیله
Orth و همکاران در ۲۰۰۲ در محدوده شرق مدیترانه گزارش شد و دیگری ما بقی محدوده گسترش این گونه
است که به وسیله محققین مذکور
macedonicus خوانده شد(.(۹ این محققین ۷) و (۹
پیشنهاد کردند که احتمالاً دو پناهگاه متفاوت برای این گونه درغرب گرجستان یا در شرق آذربایجان وجود داشته و پس از آخرین یخبندان جهانی از این نواحی گونه شروع به کلونیزاسیون مناطق مختلف کرده و قلمرو امروزه را در اختیار گرفته است. این مطالعه با افزودن تعدادی نمونه از منتهی الیه شرقی قلمرو این گونه یعنی مناطق غربی ایران سعی دارد که محدوده گسترش به سمت شرق به وسیله این گونه را مشخص کند و در مورد صحت نظریه محققین پیشین در مورد منشأ کلونیزاسیون و پناهگاهها بررسی بیشتری انجام دهد.
کامل جانور با روش کلاسیک بهینه شده فنل- کلروفرم استخراج شد (۱۲) و از نظر کیفیت و غلظت به وسیله الکتروفورز با ژل آگارز ۱/۵ درصد بررسی شد. ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندری به اندازه ۸۵۶ نوکلئوتید از نوکلئوتید ۱۵۴۳۰ تا ۱۶۲۸۶ به وسیله پرایمرهای استفاده شده در مطالعه (۱۲) با استفاده از مقدار ۴۰-۵۰ نانوگرم از
DNA و حجم ۳۰ میکرولیتر از محلول PCR متشکل از : ۱/۵ میلی مولار MgCl2 ، ۲ میلی مولار dNTP و مقدار
۱/۵ میکرومولار از هر کدام از پرایمرها و مقدار ۰/۳
میکرولیتر آنزیم Taq پلیمراز(( ۵ U / l تکثیر شد. شرایط دما و مدت زمان تکثیر عبارتند از : مدت ۵ دقیقه در دمای
۹۴ درجه سانتی گراد برای شروع و ۳۵ سیکل شامل ۹۴
درجه سانتی گراد به مدت ۳۰ ثانیه، ۵۶ درجه سانتی گراد به مدت ۳۰ ثانیه و ۷۲ درجه سانتی گراد به مدت ۱ دقیقه و در نهایت ۷۲ درجه سانتی گراد به مدت ۵ دقیقه به عنوان مرحله پایانی در نظر گرفته شد. محصول به دست آمده از PCR به وسیله آنزیم EXO-SAP تخلیص شد و جهت انجام سکانس و تعیین ترادف به مؤسسه کوثر دانش ارسال شد. در مطالعه حاضر تعداد ۱۷ هاپلوتیپ جدید از سه استان مورد مطالعه برای اولین بار شناسایی و گزارش شدند که در NCBI با شماره های HM235682 تا
HM235698 ثبت شدند.
مواد و روشها
نمونه ها: تعداد ۲۲ نمونه موش مقدونیه یا Mus
macedonicus از استانهای همدان، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی به وسیله تله شکار شدند و پس از تشریح مقداری از کبد و لوزالمعده آنها در لوله های ۲سی سی و بقیه لاشه در ظروف جداگانه در داخل الکل ۷۰ درصد قرار داده و به آزمایشگاه جهت مطالعه منتقل شدند. محل، موقعیت جغرافیایی و تعداد نمونه ها از هر منطقه در شکل
۱ و جدول ۱ نشان داده شده است.
PCR و تعیین ترادف: از کبد نمونه های داخل الکل ژنوم
۲۹۰
مرتب کردن ترادف نوکلئوتیدی و آنالیز داده ها:
سکانسهای انجام شده به وسیله CLUSTAL W که در برنامه نرم افزاری (۱۵) Mega 5 تعبیه شده است، انجام شد و بررسی و مرتب کردن نهایی به صورت دستی انجام شد.
برای در نظر گرفتن تأثیر مناطق اشباع شده احتمالی ومناطق حفاظت شده در ژنوم میتوکندری بهترین مدل استفاده شده که به وسیله نرم افزار(۱۰) Modeltest تعیین شده بود به صورت TVM+I+G در نظر گرفته شد. تنوع نوکلئوتیدی p
، هاپلوتیپی h به وسیله نرم افزار (۱۳) DNASP 4 تعیین شد. آزمون عدم انطباق یا Mismatch و همچنین آنالیز
AMOVA برای بررسی ساختار جمعیتها به وسیله نرم افزار
مجله پژوهشهای جانوری (مجله زیست شناسی ایران) جلد ۲۶، شماره ۳، ۱۳۹۲
(۲) Arlequin 3 با در نظر گرفتن گاما برابر ۰/۰۵ و پارامتر دادن چند نمونه از Mus musculus domesticus و Mus
Kimura 2 انجام شد. درخت فیلوژنتیکی پیوند همجواری musculus musculus , Mus musculus gentilulus و Mus
(Neighbor-Joining ) نیز به وسیله برنامه Mega 5 با قرار spretus به عنوان گروه Outgroups ترسیم شد.
شکل -۱ نقشه مناطق نمونه برداری در این پژوهش و نمونه های برگرفته از بانک ژنی مربوط به منابع ذکر شده در جدول .۱ علائم به شکل مثلث نمایانگر نمونه های اختصاصی این پژوهش و علائم به شکل دایره مربوط به داده های بانک ژنی است.
جدول -۱ جزئیات مربوط به نمونه های گونه Mus macedonicus مربوط به این پژوهش و داده های گرفته شده از بانک ژنی که در این پژوهش مورد بررسی قرار گرفته اند به همراه اطلاعات مربوط به محل صید، تعداد، طول و عرض جغرافیایی محل صید ( اطلاعات طول و عرض جغرافیایی برای داده های بانک ژنی در مطالعات ذکر شده قابل دسترسی است).
شماره استان شهر تعداد مطالعه طول عرض
نمونه جغرافیایی جغرافیایی
۱ همدان همدان ۴ این پژوهش ۴۸° ۳۰` ۳۴° ۴۸`
۲ همدان فامنین ۸ این پژوهش ۴۹° ۳۵° ۶`
۳ همدان ملایر ۴ این پژوهش ۴۸° ۴۸` ۳۴° ۱۸`
۴ آذربایجان شرقی مراغه ۲ این پژوهش ۴۶° ۲۴` ۳۷° ۲۶`
۵ آذربایجان غربی سلماس ۴ این پژوهش ۴۴° ۴۷` ۳۸° ۱۲`
۶ گرجستان ۲۳ Orth et al. 2002 et al. 2007 & Macholan
۷ بلغارستان ۱۹ Macholan et al. 2007
۸ سوریه ۵ Macholan et al. 2007
۹ روسیه ۲ Macholan et al. 2007
۱۰ ترکیه ۱۳ Macholan et al. 2007
۱۱ یونان ۹ Macholan et al. 2007
۱۲ اسرائیل ۱۱ Orth et al. 2002
۱۳ لبنان ۲ Macholan et al. 2007 & Orth et al. 2002
۱۴ ایران ۱۵ Macholan et al. 2007 & Gunduz et al. 2000
۲۹۱
مجله پژوهشهای جانوری (مجله زیست شناسی ایران) جلد ۲۶، شماره ۳، ۱۳۹۲
شکل – ۲ درخت پیوند همجواری یا Neighbor- Joining از تمام هاپلوتیپهای مطالعه شده در این پژوهش، علائم مربوط به هر گروه از
هاپلوتیپها در کادر پیوست زیر نشان داده شده است. برای گروه خارجی (Outgroup) از چهار نمونه گونه مختلف استفاده شده است: Mus
musculus musculus, Mus musculus domesticus , Mus spretus و Mus musculus gentilulus
۲۹۲
مجله پژوهشهای جانوری (مجله زیست شناسی ایران) جلد ۲۶، شماره ۳، ۱۳۹۲
جدول-۲ نمایانگر جمعیتها، تنوع ژنتیکی، تعداد نمونه برای هر یک از جمعیتهای مطالعه شده، تنوع نوکلئوتیدی، تعداد متوسط تفاوت نوکلئوتیدی در صد نوکلئوتید، Tajima D و. Fu`s Fs
اشتراک‌گذاری:
- در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.
