مقاله مهندسی آنزیم اکسیدوردوکتاز جدا شده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

  مقاله مهندسی آنزیم اکسیدوردوکتاز جدا شده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8 دارای ۷ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد مقاله مهندسی آنزیم اکسیدوردوکتاز جدا شده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی مقاله مهندسی آنزیم اکسیدوردوکتاز جدا شده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن مقاله مهندسی آنزیم اکسیدوردوکتاز جدا شده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8 :

چکیده:

مقدمه: احتراق سوختهای فسیلی علاوه بر آزاد سازی اکسیدهای سولفوره در محیط زیست و آلودگی های متعدد موجب بروز اختلال در روند پالایش نیز میگردد. در حال حاضر، در صنایع تصفیه از روش سولفورزدایی به طریقه شیمیایی( ( HDS استفاده میشود که دارای معایبی از جمله حذف سولفور از ترکیبات آلی هتروسیکلیک میباشد بنابراین این امر موجب استفاده از روشهای بیولوژیک گردیده است. در روش حذف میکروبی سولفور ( (BDS شاخصترین گونه باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8 میباشد که در آن مسیر سولفورزدایی توسط سیستم آنزیمی صورت میگیرد و آنزیم DszD، آنزیم کلیدی فرایند فوق میباشد.

هدف: در تحقیق حاضر جهت افزایش فعالیت آنزیم DszD از موتاسیونزایی هدفمند در جایگاه Ser63 استفاده گردید.

روش ها: جهشهای S63A ، S63V و S63T تهیه شدند و بیان آنها در میزبان مناسب انجام گردید. از آنجا که ساختمان کریستالوگرافی این آنزیم تا کنون مشخص نشده است لذا از ابزارهای بیوانفورماتیکی جهت پیش بینی ساختار سهبعدی و ثانویه آن استفاده گردید.

نتایج: در مقایسه با آنزیم نوترکیب وحشی مشاهده گردید که در جهش های S63A و S63V ، فعالیت بطور کامل خاموش گردیده است و در جهش S63T فعالیت به میزان قابل توجهی کاهش مییابد که حاکی از موقعیت استراتژیک Ser63 میباشد.

کلیدواژه ها: اکسیدوردوکتاز، رودوکوکوس اریتروپولیس، Ser63 مقدمه:
گازهـای حاصـل از احتـراق سـوخت هـای فسـیلی شـامل انـواع اکسـیدهای سـولفور، نیتـروژن، سـرب و سـایر عناصـر زیانبـار مـی باشـد. رایجتـرین تکنولـوژی جهـت کـاهش محتـوای گـوگردی ترکیبـات نفتـی در صـنایع تصـفیه جهـان HDS است که یک فرایند کاتـالیتیکی سـت کـه در آن گـوگرد آلـی تحـت فشـار بـالا و دمـای زیـاد بـا اسـتفاده از گـاز هیــدروژن در حضــور کاتالیســت هــای فلــزی احیــا شــده و بــه گــاز H2S تبــدیل مــی گــردد امــا اســتفاده از ایــن روش دارای معــایبی اســت از جملــه ایــن کــه بـیش از ۷۰ ترکیبــات هتروسـیکلیک حــاوی ســولفور ماننــدDBT و مشتقات آن به این روش مقاوم بوده و سـولفور آنهـا از محـیط عمـل خـارج نمـی شـود. در حـال حاضـر راه حلـی کـه بیشتر مـورد توجـه قرارگرفتـه اسـت روش حـذف میکروبـی گـوگرد اسـت. تـاکنون بـاکتری هـای زیـادی جداسـازی و شناسـایی شـده انـد، شـاخص تـرین آنهـا، بـاکتری رودوکوکـوس اریتروپـولیس ـ IGTS8 مـی باشـد کـه بعـد از ۴۰ ســال تــلاش فــراوان در انســتیتو تکنولــوژی نفــت وگــاز آمریکــا، توســط Kilbane در ســال ۱۹۹۰ جداســازی و شناسایی گردید کـه قـادر بـه دسـولفوره کـردن DBT و مشـتقات آن از مسـیر ۴s اسـت.ایـن بـاکتری قـادر اسـت دی بنزوتیـوفن و مشـتقات آن را بـه عنـوان تنهـا منبـع گـوگرد مصـرف نمایـد.تـاکنون مطالعـات ژنتیکـی و بیوشـیمیایی بسـیاری بـر روی ایـن بـاکتری انجـام شـده اسـت و مشـخص گردیـده اسـت کـه ایـن بـاکتری دارای ژن هـای dszA،B،C،D می باشـد کـه کـد کننـده آنـزیم هـای مونواکسـیژنازDszA, C ، آنـزیم دسـولفینازDszB و آنـزیم اکسـیدوردوکتازDszD مـی باشـد. مسـیر گـوگردزدایی در ایـن بـاکتری و سـویه هـای مشـابه آن بـا کمـک مونواکسیژنازهای سیتوپلاسمیDsz AC صـورت مـی گیـرد کـه بـه وسـیله آنـزیم ردوکتـازDszD حمایـت شـده و

سـپس بـه وسـیله آنـزیم دسـولفینازDszB کامـل مـی گـردد. ژن dszD آنـزیم فلاویـن ردوکتـاز (DszD) بـه وزن تقریبـی ۲۲ کیلودالتـون را کـد مـی کنــد، دارای ۱۹۲ اسـیدآمینه اسـت و در محـیط بیولوژیــک بـه صـورت تترامـر قــرار دارد. بــا دســتکاری ژنتیکــی ژن هــای دخیــل در مســیر ســولفورزدایی بیولوژیــک مــی تــوان بــه ســرعت دلخــواه در تجــاری ســازی ســوش مــوردنظر دســت یافــت. بنــابراین آنــزیم فــوق بعنــوان یکــی از آنــزیم هــای کلیــدی در مسیرســولفورزدایی توجــه محققــین را جلــب کــرده اســت. بــا توجــه بــه اینکــه تــاکنون ســاختار کریســتالوگرافی ایــن آنـزیم مشــخص نشــده اســت بنــابراین در تحقیـق حاضــر ابتــدا بــا اســتفاده از ابزارهـای بیوانفورماتیــک اقــدام بــه پــیش گـویی سـاختار دوم و ســوم ایـن آنـزیم شــده اسـت و ســپس بـا اسـتفاده از انطبــاق فضـایی مولکـول هــای مـدل ماننــد HpaCSt و PheA2 در مولکــول پــیش گــویی شــده و معــادل ســازی اتمهــای هرکــدام از مولکــول هــای مــدل کــه می توانند دارای موقعیت پیونـدی مهـم بـا سوبسترایشـان باشـند بـه ایـن نتیجـه دسـت یـافتیم کـه اسـید آمینـه S63 می تواند بعنوان یکی از جایگاه هـای مهـم در مرکـز فعـال پـیش گـویی شـده آنـزیم مربوطـه مطـرح باشـد، بنـابراین در ایــن مطالعــه بــا تغییــر و جانشــینی Ser بــه جــای Ala، Val و Thr مشــخص شــد کــه فعالیــت هــر یــک از جهــش های حاصله در مقایسه با آنزیم نوترکیب کاهش نشان می دهد که حاکی از اهمیت جایگاه سرین می باشد