مقاله بررسی بیوانفورماتیکی microRNAs برای شناسایی ژنها و مسیرهای سلولی مرتبط با مدولوبلاستوما

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

  مقاله بررسی بیوانفورماتیکی microRNAs برای شناسایی ژنها و مسیرهای سلولی مرتبط با مدولوبلاستوما دارای ۱۰ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد مقاله بررسی بیوانفورماتیکی microRNAs برای شناسایی ژنها و مسیرهای سلولی مرتبط با مدولوبلاستوما  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی مقاله بررسی بیوانفورماتیکی microRNAs برای شناسایی ژنها و مسیرهای سلولی مرتبط با مدولوبلاستوما،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

بخشی از متن مقاله بررسی بیوانفورماتیکی microRNAs برای شناسایی ژنها و مسیرهای سلولی مرتبط با مدولوبلاستوما :

تعداد صفحات:۱۰

چکیده:

مقدمه: مدولوبلاستوما شایعترین بدخیمی رایج در میان تومورهای مغزی کودکان می باشد. مکانیسمهای مولکولی مرتبط با این تومورها تاکنون به طور کامل شناسایی نشده است. تحقیقات اخیر نقش microRNAs را در تنظیم فرآیندهای مربوط به مدولوبلاستوما اثبات کرده است. microRNAs ها با اتصال به ناحیه ۳’UTR رونوشت یک ژن سبب تنظیم بیان آن می شود. مطالعات انجام شده تنظیم کاهشی پنج hsa- mir-124, has-miR-128a, has-miR-138, has-miR-150, miRNA و has- leT-7g را در مدولوبلاستوما تأئید کرده است. هدف: بررسی ابیوانفورماتیکی این miRNA ها به منظور شناسایی ژنها و مسیرهای سلولی مرتبط با مدولوبلاستوما و معرفی هدف های درمانی جدید برای این سرطان شایع در میان کودکان می باشد. روش: توالیهای مربوط به این miRNA ها از بانک اطلاعاتی miRBase دانلود و از برنامه های Target Scan, PicTar, miRanda و MicroCosm برای جست و جوی تمامی توالیهای ۳’UTR رونوشتهای ژنهای موجود در بانکهای اطلاعاتی NCBI و ENSEMBL که جایگاه اتصال برای این miRNA ها را داشتند استفاده شد. پایگاههای اطلاعاتی BBID, KEGG و BIOCARTA برای شناسایی مسیرهای سلولی مرتبط با این ژنها و miRNA ها مورد استفاده قرار گرفت. همچنین برای شناسایی خوشه های ژنی که جایگاهها اتصالی مشابه برای miRNA ها و درنتیجه الگوی تنظیمی مشابه را دارند از روش خوشه بندی سلسله مراتبی با استفاده از نرم افزارهای Cluster3و Tree View و انجام آنالیزهای آماری مربوط انجام شد. هم ترازی توالی miRNA ها نیز توسط برنامه تحت وب T-Coffee انجام شد. نتیجه: در مجموع صد و نه ژن با تعداد جایگاههای پنج، چهار و سه برای miRNA های مورد نظر شناسایی شد. از این بین ژن ARAF با کسب بیشترین امتیاز در صدر ژنهای شناسایی شده با پنج جایگاه اتصال برای miRNA قرار گرفت. ژنهای RRAS, RHOT2, LIPH, CTPS2, RAB34, BAX, PDCD6, SOCS از جمله ژنهای مهم شناسایی شده بودند که نقش این ژنها در سایر سرطانها تأئید شده است. دوازده مسیر سلولی مرتبط با این ژنها یافت شد که از این بین دو مسیر سلولی مربوط به آبشارهای پیام رسانی و فرآیندهای متابولیکی پروتئینهای سلولی از جمله مهمترین مسیرها بودند. نتایج حاصل از خوشه بندی سلسله مراتبی نشان داد که hsa-miR-150، hsa-miR-128a در یک خوشه قرار گرفته و در نتیجه الگوی تنظیمی مشابه ای را دارا هستند. همچنین هم ترازی ا نجام شده بین جفت miRNA ها این موضوع را که این دو miRNA دارای بیشترین تشابه در ناحیه تنظیمی خود هستند را تأئید کرد.